Biochemie und Pathobiochemie: Purin-Stoffwechsel

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Inhaltsverzeichnis

[Bearbeiten] Allgemeines

Purine sind wichtige Biomoleküle. Sie bilden neben den Pyrimidinen die Bausteine der DNA, dienen als mobile Energiewährung und sind Ausgangsstoff des Biopterins und wichtiger intrazellulärer Signalmoleküle. Das primäre Abbauprodukt der Purine ist die Harnsäure.

[Bearbeiten] Synthese von Inosin-5'-monophosphat (IMP)

All. Subst. ( ⇑ ) Co. Enzym EC EG Erkr.
α-D-Ribose-5-phosphat
ATP

AMP

Ribose-phosphat- Diphosphokinase 2.7.6.1 Tr Gicht, PRPS- assoz.
α-D-5-Phosphoribosyl- 1-pyrophosphat (PRPP)
+ PRPP

- AMP, ADP, ATP, GMP, GDP, GTP

Glutamin

PPi, Glutamat

Amidophosphoribosyl- transferase 2.4.2.14 Tr
5-Phosphoribosylamin (PRA)
ATP, Glycin

ADP + Pi

Phosphoribosylamin--Glycin-Ligase 6.3.4.13 Lig
Glycinamidribonucleotid (GAR)
N10-Formyl-THF

THF

Phosphoribosylglycinamid- Formyltransferase 2.1.2.2 Tr
Formylglycinamid- ribonucleotid (FGAR)
ATP, Glutamin

ADP + Pi, Glutamat

Phosphoribosylformyl- glycinamidin-Synthase 6.3.5.3 Lig
Formylglycinamidin- ribonucleotid (FGAM)
ATP

H2O, ADP + Pi

Phosphoribosylformyl- glycinamidin-Cyclo-Ligase 6.3.3.1 Lig
5-Aminoimidazol- ribonucleotid (AIR)
CO2


Phosphoribosylaminoimidazol- Carboxylase 4.1.1.21 Ly
5-Aminoimidazol- 4-carboxylatribonucleotid (CAIR)
ATP, Aspartat

ADP + Pi

Phosphoribosylaminoimidazol- succinocarboxamid-Synthase 6.3.2.6 Lig
5-Aminoimidazol- 4-N-succino- carboxamid- ribonucleotid (SAICAR)


Fumarat

Adenylosuccinat-Lyase 4.3.2.2 Ly ADSL-Def. (Succinyl- purinämischer Autismus)
5-Aminoimidazol- 4-carboxamid- ribonucleotid (AICAR)
N10-Formyl-THF

THF

Phosphoribosylaminoimidazol- carboxamid-Formyltransferase 2.1.2.3 Tr AICA- Ribosurie
5-Formamidoimidazol- 4-carboxamid- ribonucleotid (FAICAR)


H2O

IMP-Cyclohydrolase 3.5.4.10 Hyd AICA- Ribosurie
Inosin-5'-monophosphat (IMP)
Zusammenfassung: Herkunft der Atome des Puringerüstes.
Nummerierung der Atome des Purinkerns.

Das Trägermolekül Ribose-5-phosphat, an dem die Purinbase synthetisiert wird, stammt aus dem Pentosephosphatweg.

Der fertige Purinkern besteht aus 5 Kohlenstoff- und 4 Stickstoffatomen. Der Kohlenstoff stammt aus Glycin (2 C), 2 Formylresten aus 2 N10-Formyl-Tetrahydrofolsäure und 1 Kohlendioxid. Der Stickstoff stammt aus den nicht-essentiellen Aminosäuren Glycin, Glutamin (2x) und Aspartat.

Chemisch betrachtet besteht das Molekül aus zwei verschiedenen zusammenhängenden stickstoffhaltigen Ringsystemen (ein Pyrimidin und ein Imidazol), mit aromatischen Eigenschaften.

Die Purinbasen sind über ihr N-Atom 9 mit dem C-Atom 1' der Ribose verbunden.

[Bearbeiten] Synthese von AMP aus IMP und Desaminierung zu IMP

All. Subst. ( ⇑ ) Co. Enzym EC EG Erkr.
Inosin-5'- monophosphat (IMP)
+ GTP GTP, Aspartat

GDP + Pi

Adenylosuccinat-Synthase 6.3.4.4 Lig
Adenylosuccinat


Fumarat

Adenylosuccinat-Lyase 4.3.2.2 Ly ADSL-Def. (Succinyl- purinämischer Autismus)
Adenosin-5'- monophosphat (AMP)
H2O

NH3

AMP-Deaminase 3.5.4.6 Hyd MADA-Def. (Myopathie), AMPD3-Def.
Inosin-5'- monophosphat (IMP)

[Bearbeiten] Synthese von GMP aus IMP und Desaminierung zu IMP

All. Subst. ( ⇑ ) Co. Enzym EC EG Erkr.
Inosin-5'- monophosphat (IMP)
H2O, NAD+

NADH/H+

IMP-Dehydrogenase 1.1.1.205 Ox
Xanthosin-5'- monophosphat (XMP)
+ ATP H2O, ATP, Glutamin

AMP + PPi, Glutamat

GMP-Synthase (Glutamin-hydrolysierend) 6.3.5.2 Lig Retinitis pigmentosa 10 (RP10), Leber congenital amaurosis XI (LCA11)
Guanosin-5'- monophosphat (GMP)
NADPH/H+

NH3, NADP+

GMP-Reduktase 1.7.1.7 Ox
Inosin-5'- monophosphat (IMP)

[Bearbeiten] Regulation

Das Schrittmacherenzym der Purin-Biosynthese, die Amidophosphoribosyltransferase wird durch die Endprodukte der Purin-Bildung gehemmt und durch PRPP stimuliert.

Nach der Verzweigungsstelle IMP findet man einen sinnigen Mechanismus, der beide Zweige im Gleichgewicht hält. ATP stimuliert die GMP-Synthese, so dass das IMP eher dort hin fließt. GTP stimuliert wiederum die AMP-Synthese, so dass das IMP wieder vermehrt in die andere Richtung fließt.

[Bearbeiten] Stoffwechsel der Adenin- und Guaninnucleotide

Zyklisches Adenosin- monophosphat (cAMP), ein wichtiger sekundärer Botenstoff.
  • Die Nukleotide AMP und GMP und ihre Deoxyderivate dAMP und dGMP stellen die eine Hälfte der Bausteine der Nukleinsäuren (RNA und DNA).
  • ATP und GTP dienen der Zelle als universelle „Energiewährung“, die vielen biochemischen Reaktionen die Energie liefert (die ATP-Hydrolyse ist stark exergon und verschiebt das Reaktionsgleichgewicht auf die Seite der Hydrolyse). Das ATP wird hauptsächlich von der ATP-Synthase an der inneren Mitochondrienmembran unter Sauerstoffverbrauch aus ADP und Pi erzeugt (Oxidative Phosphorylierung), zum Teil auch in der Glycolyse gewonnen (Substratkettenphosphorylierung). Letzteres wird von der Zelle besonders unter anaeroben Bedingungen genutzt. Eine weitere Substanz, die ein so hohes Gruppenübertragungspotential hat, dass sie ihr Phosphat auf ADP übertragen kann ist das Kreatinphosphat. Da das Kreatinphosphat das Phosphat vorher vom ATP übernommen hat entsteht hier netto kein neues ATP, Kreatinphosphat fungiert hier nur als „Zwischenspeicher“, um kurzzeitige ATP-Versorgungsengpässe auszugleichen. GTP entsteht z.B. indem GDP ein Phosphat von ATP übernimmt oder durch Substratkettenphosphorylierung im Citratzyklus. ATP treibt viele biochemische Reaktionen des Intermediärstoffwechsels an wie auch Proteine, z.B. ATP-abhängige Pumpen wie die Natrium-Kalium-Pumpe. Weiterhin liefert ATP auch meist das Phosphat für die Phosphorylierung von Proteinen durch Proteinkinasen. GTP treibt v.a. molekularbiologische Prozesse an wie z.B. den Transport von Kernproteinen in den Zellkern (Importine), die Proteinbiosynthese am Ribosom und den Aufbau der Mikrotubuli.
  • ATP und GTP können von G-Protein-gesteuerten Enzymen (Adenylatzyklase, Guanylatzyklase) in zyklisches AMP (3',5'-cyclo-AMP, cAMP) und GMP (cGMP) umgewandelt werden, die wichtige second messenger darstellen (Botenstoffe der intrazellulären Signalübertragung).
  • GTP ist auch der Rohstoff der Biopterin-Biosynthese.


Im Folgenden sind beispielhaft die möglichen Umwandlungen der Adeninnukleotide tabellarisch aufgeführt:

Reaktion Co. Enzym EC EG Erkr.
AMP + ATP 2 ADP Adenylat-Kinase 2.7.4.3 Tr AK1-Def. (Hämolyt. Anämie)

ADP + H2O

ATP + H2O

ATP + H2O

AMP + Pi

AMP + 2 Pi

ADP + Pi

Ca Apyrase 3.6.1.5 Hyd
ADP + Pi ATP + H2O FoF1-ATPase 3.6.3.14 Hyd MTATP6-Def. (Leigh-S., NARP-S., Leber Opticusatrophie)
ATP + NDP ADP + NTP Nucleosid-diphosphat-Kinase 2.7.4.6 Tr
ADP + 1,3-BPG ATP + 3-PG Phosphoglycerat-Kinase 2.7.2.3 Tr PGK1-Def. (Hämolyt. Anämie, Myopathie)
ADP + PEP ATP + Pyruvat Pyruvat-Kinase 2.7.1.40 Tr PKLR-Def. (Hämolyt. Anämie)
ATP + Kreatin ADP + Kreatin-P Kreatin-Kinase 2.7.3.2 Tr
ATP + H2O ADP + Pi Adenosintriphosphatase 3.6.1.3 Hyd Hämolyt. Anämie
NTP + RNAn PPi + RNAn+1 DNA-abhängige RNA-Polymerase 2.7.7.6 Tr
RNAn+1 + Pi RNAn + NDP Polyribonucleotid-Nucleotidyltransferase 2.7.7.8 Tr
ATP 3',5'-cyclo-AMP + PPi Adenylat-Cyclase 4.6.1.1 Ly
3',5'-cyclo-AMP + H2O AMP 3',5'-cyclo-Nucleotid-Phosphodiesterase 3.1.4.17 Hyd
ADP + Thioredoxin dADP + Thioredoxin- Disulfid + H2O Ribonucleosid-diphosphat-Reduktase 1.17.4.1 Ox
ATP + dNDP ADP + dNTP Nucleosid-diphosphat-Kinase 2.7.4.6 Tr
dADP + PEP dATP + Pyruvat Pyruvat-Kinase 2.7.1.40 Tr PKLR-Def. (Hämolyt. Anämie)
NTP + DNAn PPi + DNAn+1 DNA-abhängige DNA-Polymerase 2.7.7.7 Tr
dAMP + dATP 2 dADP Adenylat-Kinase 2.7.4.3 Tr AK1-Def. (Hämolyt. Anämie)
dAMP + H2O Deoxyadenosin + Pi 5'-Nucleotidase 3.1.3.5 Hyd
Deoxyadenosin + PO4H3 Adenin + 2-Deoxy-D-Rib-1-P Purin-nucleosid-Phosphorylase 2.4.2.1 Tr Ataxie m. zellulärem Immundefekt
Thymidin-Phosphorylase 2.4.2.4 Tr MNGIE-S.
Deoxyadenosin + H2O Deoxyinosin + NH3 Adenosin-Deaminase 3.5.4.4 Hyd
Deoxyinosin + Pi Hypoxanthin + 2-Deoxy-D-Rib-1-P Purin-nucleosid-Phosphorylase 2.4.2.1 Tr Ataxie m. zellulärem Immundefekt
Thymidin-Phosphorylase 2.4.2.4 Tr MNGIE-S.

[Bearbeiten] Pharmakologie

Die Purinsynthese kann durch Blockade des Folat-Stoffwechsels behindert werden, z.B. mit dem Dihydrofolatreduktase-Hemmer Methotrexat (MTX). In der Folge kommt es zu einem Mangel an DNA-Bausteinen und zu einer Hemmung der Zellvermehrung vor allem von proliferationsfreudigen Geweben. Dies macht man sich in der Therapie von Krebs (Tumorzellen) und Autoimmunerkrankungen (Immunzellen) zunutze.

[Bearbeiten] Purine werden zu Harnsäure abgebaut

Alternative Darstellung (kompakt)


Subst. (⇑) Subst. (⇑) Subst. (⇑) Subst. (⇑)

AMP

IMP

XMP

GMP

H2O

Pi

5'-Nucleotidase 1. H2O

Pi

5'-Nucleotidase 1. H2O

Pi

5'-Nucleotidase 1. H2O

Pi

5'-Nucleotidase 1.

Adenosin

H2O

NH3

Adenosin-Deaminase 2.

Inosin

Xanthosin

Guanosin

Pi

Rib-1-P

Purin-nucleosid-Phosphorylase 3. Pi

Rib-1-P

Purin-nucleosid-Phosphorylase 3. Pi

Rib-1-P

Purin-nucleosid-Phosphorylase 3.

Hypoxanthin

Guanin

O2, H2O

O2-, 2H+

Xanthin-Oxidase (XOD) 4. H2O

NH3

Guanin-Deaminase 5.
Xanthin
O2, H2O

O2-, 2H+

Xanthin-Oxidase (XOD) 4.

Harnsäure

(Ketoform)

⇌ Harnsäure ⇌

(Enolform)

Harnsäure

(dissoz., pK = 5,4)

Enzym Co. EC EG Erkr.
1) 5'-Nucleotidase 3.1.3.5 Hyd
2) Adenosin-Deaminase 3.5.4.4 Hyd Severe combined immunodeficiency (SCID)
3) Purin-nucleosid-Phosphorylase 2.4.2.1 Tr Ataxie mit zellulärem Immundefekt
4) Xanthin-Oxidase (XOD) FAD, FeS, Mo 1.17.3.2 Ox Xanthinurie I
5) Guanin-Deaminase 3.5.4.3 Hyd
Strukturformel von Allopurinol.

Primaten, Vögel und einige Reptilien bauen Purine bis zur Harnsäure ab, die über den Urin ausgeschieden wird. Andere Tiere bauen die Harnsäure weiter ab zu besser wasserlöslichen Produkten wie Allantoin (die meisten Säugetiere), Harnstoff und Glyoxylsäure (Fische) oder Ammoniak (marine Invertebraten).

Harnsäure besitzt vermutlich eine antioxidative Wirkung, was den Verlust der Harnsäure-abbauenden Enzyme trotz des Nachteils der schlechteren Wasserlöslichkeit für Primaten u.a. Tiere lohnend gemacht haben könnte.

Pathobiochemie: Ein übermäßiger Anfall von Harnsäure (purinreiche Kost (Innereien, Wurst), Tumorlyse) und/oder eine verschlechterte renale Ausscheidung (erbliche Transporter-Defekte, Alkohol (-> Acetat) und ASS durch Konkurenz am tubulären Säuretransporter) führen zur Gicht. Hier kommt es durch die Überschreitung des Löslichkeitsprodukts zum Ausfällen von scharfkantigen Uratkristallen im Gewebe, die lokal eine Entzündungsreaktion hervorrufen.

Pharmakologie: Die Xanthinoxidase kann durch das Hypoxanthin-Analogon Allopurinol gehemmt werden. Die Harnsäurebildung nimmt dadurch ab, die Bildung der besser wasserlöslichen Metaboliten Xanthin und Hypoxanthin nimmt zu.

[Bearbeiten] Salvage Pathway

All. ( ⇓ ) Subst. Co. Enzym EC EG Erkr.
Adenosin-5'-monophosphat (AMP)
- AMP PPi

PRPP

Adenin-Phosphoribosyl- transferase (APRT) 2.4.2.7 Tr APRT-Def.
- IMP, GMP Hypoxanthin-Phosphoribosyl- transferase (HGPRT) 2.4.2.8 Tr HPRT-Def.: Kelley-Seegmiller-S., Lesch-Nyhan-S.
Adenin
All. ( ⇓ ) Subst. Co. Enzym EC EG Erkr.
Inosin-5'-monophosphat (IMP)
- IMP, GMP PPi

PRPP

Hypoxanthin-Phosphoribosyl- transferase (HGPRT) 2.4.2.8 Tr HPRT-Def.: Kelley-Seegmiller-S., Lesch-Nyhan-S.
Hypoxanthin
All. ( ⇓ ) Subst. Co. Enzym EC EG Erkr.
Xanthosin-5'-monophosphat (XMP)
- IMP, GMP PPi

PRPP

Hypoxanthin-Phosphoribosyl- transferase (HGPRT) 2.4.2.8 Tr HPRT-Def.: Kelley-Seegmiller-S., Lesch-Nyhan-S.
Xanthin
All. ( ⇓ ) Subst. Co. Enzym EC EG Erkr.
Guanosin-5'-monophosphat (GMP)
- AMP PPi

PRPP

Adenin-Phosphoribosyl-transferase (APRT) 2.4.2.7 Tr APRT-Def.
- IMP, GMP Hypoxanthin-Guanin-Phosphoribosyl-transferase (HGPRT) 2.4.2.8 Tr Kelley-Seegmiller-S., Lesch-Nyhan-S.
Guanin

Die Purinbasen Adenin, Hypoxanthin, Xanthin und Guanin können mit Hilfe zweier Enzyme wiederverwertet werden, indem sie mit einem Phosphoribosylrest wieder zum Nucleotid aufgebaut werden. Dies ist sehr sinnvoll, da damit erstens ATP eingespart werden kann (die Bildung eines Purins kostet mindestens 7 (AMP) bzw. 9 (GMP) energiereiche Phosphatbindungen) und zweitens die Harnsäurebildung drastisch reduziert wird.

Pathologie: Beim x-chromosomal-rezessiven Lesch-Nyhan-Syndrom kommt es aufgrund eines Defektes der Hypoxanthin-Guanin-Phosphoribosyltransferase (HGPRT) zur fehlenden Rückgewinnung der Purinbasen und einem Überschuss an PRPP. Letzteres setzt zusammen mit dem Nukleotid-Mangel eine exzessive Purin- und damit Harnsäureproduktion in Gang. Die Erkrankung manifestiert sich in schweren neurologischen Störungen und Automutilation (Selbstverstümmelung), sowie Harnsäuresteinen. Eine abgeschwächte Form dieser Erkrankung mit einer HGPRT-Restfunktion stellt das Kelley-Seegmiller-Syndrom dar. Hier steht klinisch die Bildung von Harnsäuresteinen und die Harnsäurennephropathie im Vordergund.

[Bearbeiten] Weblinks



Allgemeine Hintergrundfarbe für Substrate Hintergrundfarbe Reaktionspfeile „Schlüsselenzyme“
Energiereiche Phosphate Reduktionsäquivalente CO2 / HCO3 C1-Reste Stickstoff

Abk.: Tr.: Transkriptionelle Regulation, Tl.: Regulation der Translation, Lok.: Regulation über die Enzymlokalisation, Kov.: Regulation durch kovalente Modifikation, All.: Allosterische Regulation, Koop.: Kooperativer Effekt, Co.: Cofaktoren, EC: Enzymklassifikation, EG: Enzymgruppe (Oxidoreductase, Transferase, Hydrolase, Lyase, Isomerase, Ligase), Erkr.: Assoziierte Erkrankungen.



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