Medizinische Informatik: Pubmed

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Inhaltsverzeichnis

[Bearbeiten] Allgemeines über Pubmed

Vorteile: Pubmed ist sehr umfassend , kostenlos, 
online zugänglich, medizinische Abstracts seit 1966 

PubMed ist eine englischsprachige textbasierte Datenbank mit medizinischen Artikeln der nationalen medizinischen Bibliothek der Vereinigten Staaten. (Wikipedia-logo.png National Library of Medicine, NLM). (ref McEntyre, J. & Lipman D. (2001): PubMed: bridging the information gap. In: CMAJ. Bd. 164, S. 1317-1319. PMID 11341144 PDF) Entwickelt wurde die Datenbank durch das nationale Zentrum für Biotechnologische Informationen (Wikipedia-logo.png National Center for Biotechnology Information, NCBI). PubMed ist die kostenfreie Version der Datenbank Wikipedia-logo.png MEDLINE.

Die Datenbank ist zu erreichen über Wikipedia-logo.png NCBI-Entrez, dem zentralen Suchsystem für die wichtigsten medizinischen Datenbanken einschließlich PubMed, PubChem, Nukleotid- und Protein-Sequenzen, Protein-Strukturen, Komplexe Genome und andere.

PubMed selbst dokumentiert medizinische Artikel in Fachzeitschriften und ist mit Links auf Volltextzeitschriften ausgestattet. Es handelt sich um eine Wikipedia-logo.png bibliografische Referenzdatenbank (Nachweis von Zeitschriftenartikeln: etwa 15 Millionen „Zitate“).

Beginn 1966

Das Sachgebiet umfasst

  • Medizin,
  • Zahnmedizin,
  • Veterinärmedizin,
  • öffentliches Gesundheitswesen,
  • Psychologie,
  • Biologie,
  • Genetik,
  • Biochemie,
  • Zellbiologie,
  • Biotechnologie,
  • Biomedizin usw.

Verzeichnet sind etwa 3.800 biomedizinische Zeitschriften. Jährlich wächst PubMed um rund 500.000 Dokumente. Die Verschlagwortung erfolgt nach Wikipedia-logo.png Medical Subject Headings (MeSH).

Jeder Eintrag in der PubMed ist eine PubMed-ID Nummer (PMID) zugeordnet.

[Bearbeiten] Bedienung

Die Bedienung von Pubmed ist recht einfach: Für eine erste Abfrage gibt man ein Stichwort ein und klickt auf "GO".

Siehe auch http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=helppubmed.section.pubmedhelp.Searching_PubMed

[Bearbeiten] Hilfetexte

Eine ausführliche Anleitung findet man unter http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/pubmedhelp.html, komplexere Suchanfragen mit logischen Verknüpfungen (AND,OR, NOT) lassen sich bei http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/medline.html eingeben. Neben den bibliographischen Daten kann auf Wunsch auch der komplette Abstract mitangezeigt werden.

[Bearbeiten] Suche nach bestimmten Stichwörtern

In Pubmed einfach das Stichwort eingeben und suchen lassen. Sehr praktisch ist die Suchmöglichkeit nach Related Artikels = Verwandten Artikel

Die englischen Stichwörter zu den deutschen Worten bekommt man am besten über die MESH Terms

Erst deutsches Wort eingeben. Einen gefundenen Artikel anschauen und im Medline Format darstellen .

Dort finden sich die Angaben MH : Stichworte. Jetzt kann man die passenden englischen Worte wählen und erhält ein umfassenderes Suchergebnis.

zB Katzenkratzkrankheit ==> kein Ergebnis

Wenn das nicht klappt muß man sich das Wort in einem Lexikon übersetzen lassen: zb http://dict.leo.org/ ==> kein Ergebnis

Oder man sucht erst mal im Roche Lexikon , dort steht immer der englische Begriff dabei: cat scratch disease

Den gefundenen Begriff gibt man dann wieder in PubMed ein.

[Bearbeiten] Kombination von Stichwörtern

In Pubmed einfach die 2 Wörter hintereinander eingeben

zb type 2 diabetes

[Bearbeiten] Suche nach einem bestimmten Autor

In Pubmed einfach den Namen eingeben , evt Fachgebiet dazu eingeben

zb Bachmann Diabetes

Besser wird das Ergebnis durch Zugabe des ersten Buchstabens des Vornamens zb

Bachmann W Diabetes 

Alternativeingabe zb : AU = Bachmann

[Bearbeiten] Suche nach einem bestimmten Dokument dessen UI Nummer man kennt

Jedes Dokument in Pubmed hat eine bestimmte Nummer.

Früher hieß diese Nummer ND = Number of document

Jetzt heißt Sie UI = Unique Identifikation

Diese Nummer wird immer in der letzten Zeile der Abstract Ansicht angezeigt. Sucht man zB den Artikel mit der Nummer UI = 96151741, dann gibt man ins Suchfeld folgendes ein: UI = 96151741

[Bearbeiten] Eingrenzung der Suche an Hand der Jahresangabe

In Pubmed auf der ersten Seite Entrez Date limit: auswählen

[Bearbeiten] Eingrenzung an Hand der Sprache ( zB Englisch , Deutsch )

Sprache = Language [LA] Die Sprache in der der Artikel veröffentlicht wurde. Beachten Sie das viele Nichtenglische Artikel trotzdem ein englisches Abstrakt haben. Beachten Sie : Man kann auch einfach die ersten drei Buchstaben einer Sprache eingeben zb ger [LA] , man erhält dasselbe Ergebnis wie mit german [LA] :

Beispiel : cat scratch disease AND german[LA]

Man erhält alle deutschen Artikel über die Katzenkratzkrankheit.

Das funktioniert kürzer auch mit :

cat scratch disease AND ger[LA]

Man erhält alle Artikel über die Katzenkratzkrankheit in deutscher Sprache

[Bearbeiten] Eingrenzung an Hand der Zeitschrift ( zB Lancet oder NEJM)

Der Zeitungstitel wird unter Source SO abgespeichert.

Will man zB alle Artikel aus dem Lancet haben , gibt man folgendes ein:

  • SO = lancet

Will man alle Artikel über den Herzinfarkt, die im Lancet veröffentlicht wurden , gibt man folgendes ein:

acute myocardial infarction AND SO = lancet 

[Bearbeiten] Weitere Zeitschriften Titel:

  • SO = N Engl J Med ( New England Journal of Medicine )
  • SO = Z Kardiol ( Zeitschrift für Kardiologie )
  • SO = Med Klin ( Medizinische Klinik )
  • SO = Dtsch Med Wochenschr ( DMW)

Das Deutsche Ärzteblatt ist nicht in Medline zu finden !

Datenbank aller Pubmed Zeitschriften:

Pubmed Journal Database Browser http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/jbrowser.html

[Bearbeiten] Bestellung der Orginalarbeit über die BSB oder die ZBM

ACHTUNG: die Bestellung einer Orginalarbeit ist nicht ganz billig !

[Bearbeiten] Literatur

[Bearbeiten] Siehe auch

[Bearbeiten] Weblinks

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